13종류의 Codon Table[1]을 선택가능하며, Translation하는 영역을 수동으로 입력하는 방법은 물론 Feature나 ORF를 자동으로 검색하여 그 부분만 Translation할 수 있습니다. 기본값으로 설정된 Default (1.CDS in FEATURE Field 2.Longest ORF) 옵션은 시퀀스 FEATURE에 CDS가 있으면 CDS부분을 Translation하고 CDS가 없다면 ORF Search하여 그 결과 중 가장 긴 것을 Translation합니다.
Translation 할 시퀀스를 sequence창에 입력 후 Codon Table을 선택하여 Translation할 영역을 설정하기 위해서 "Direction"옵션과 "Mode of translation"옵션을 조정합니다. Direction 옵션은 Mode of translation옵션으로 영역 선택할 때의 기준이 됩니다.
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Codon은 Amino acid로 바뀔 수 있는 3개의 DNA의 나열을 말한다. Codon Table은 3개의 뉴클레오타이드가 Amino acid로 바뀌는 규칙을 정리한 Table이다 |