시퀀스를 분석하기 위해서 먼저 시퀀스를 시퀀스 입력박스에 입력합니다. 시퀀스를 시퀀스 입력 박스에 입력하기 위해서는 직접 시퀀스를 입력하시거나 "Load Sequence" 버튼을 클릭하여 Sequence Loader를 사용하십시오. 시퀀스가 특정한 형식을 따르지 않는 일반 텍스트나 FASTA형식의 시퀀스라면 필요한 경우 시퀀스 Topology를 선택하시기 바랍니다.
두 번째로 분석 옵션을 설정합니다. 옵션의 자세한 내용은 각 프로그램 설명을 참조하시기 바라며 잘 모르시겠다면 그냥 기본 상태로 두어도 충분히 원하는 결과를 얻을 수 있습니다.
세 번째로 분석을 실행하기 위해서 " G O "버튼을 클릭하여 프로그램을 수행하십시오.
각 프로그램에 대한 보다 자세한 사용법은 각 프로그램의 설명을 참조하시기 바랍니다.