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백터 맵 예쁘게 그리기 1/3
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플라스미드 맵 그리기, 기초화장에서 관리까지
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| 작성일 : 2003/01/03 |
실험실의 중요한 자산인 유전자와 벡터들이 생각만큼
그리 잘 관리되지 않는 다는 것은 아마 독자 여러분들이 대부분
경험했던 일일 것이다. 담당 연구원이 퇴직하거나 선임자들이 외국으로
훌쩍 떠나고 나면, 그들이 남겨둔 몇 장의 인수인계서와 연구 노트에는 사라진
정보가 왜 그리도 많은지? 겨우 찾아낸 벡터 맵을 보고 안도의 한숨을 내쉬긴
하지만 누군가'확인해보니 이상하던데요'라는 한마디를 던지면 그제서야 그
유전자 하나를 얻기 위해 얼마나 많은 이메일을 쓰고 노심초사 기다렸던지 하고
후회를 하게 된다. 이미 늦긴 했지만.
실험실의 가장 소중한 자산중의 하나인 유전자 자원이 제대로 관리되지 않는
이유는 무엇보다 통일된 관리 규격이 없기 때문일 것이다. 연구원마다 취향이
다른 것도 문제거니와 유전자 서열정보와 이를 한눈에 표시한 맵을 관리할 수
있는 툴이 부재한 것도 문제이며, 서열정보와 같은 디지털 데이터와 실물 데이터
(예컨데 어느 박스 몇 번 위치에 이런 DNA가 있다는 식의) 사이의 고리가 될 만한
관리 툴이 없는 것도 문제라고 할 수 있다. 이 모든 것을 한번에 해결하기란 사실
쉽지 않으며 구성원 사이의 문제 의식 공유에서부터 관리 지침의 준수, 그리고
적절한 인프라의 제공에 이르는 다층적인 솔루션이 필요할 것이다. 천리길도
한 걸음부터, 이번 호에서는 실험실에 굴러다니는 DNA들에 대한 통일된 서열
정보를 관리할 수 있고, 이를 예쁜 맵으로 관리할 수 있게 해주는 툴을
소개함으로써 그 첫걸음을 떼어 보기로 하자.
엔사이클론 (http://www.encyclon.net )은 30 여개 이상의 서로 다른
유전자 분석 소프트웨어가 일정한 주제를 가지고 패키지화 되어 있는 프로그램이다.
인터넷을 통해 언제든지 접속할 수 있으며, 간단한 회원가입 절차를 거치면 모든 기능을 무료로 사용할 수 있다.
엔사이클론의 세세한 기능들을 소개하는 것은 다음 기회로 미루기로 하고, 이번에는 애초의 문제의식에 충실하게,
벡터 맵을 예쁘게 그리고, 이를 서열 정보와 연동하여 관리하는 방법에 대해 소개하기로 하자.
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