여러 개의 시퀀스를 한번에 align 하자.

Needle을 편하게 사용해 보자.

하나의 기준 시퀀스로 여러 개의 시퀀스를 align 해야 할 때 시퀀스 개수만큼 Needle 페이지에서 시퀀스 입력하고 기준 시퀀스 입력하고 'GO' 버튼을 눌러야 했다. 이러한 불편을 조금이라도 줄여보기 위해 Needle에서도 멀티 시퀀스를 지원하게 되었다.

이용방법

Needle 페이지를 살펴보자. 기본적으로 변한 것은 없어 보인다.

그럼 어디서 무엇을 해야 여러 개의 시퀀스를 한번에 align을 할 수 있을까? Sequence A 의 Upload 버튼을 누르면 다음과 같이 MultiBlast에서 제공되는 '시퀀스 업로드' 창이 뜹니다.

'파일 추가' 버튼을 이용해서 로컬 디스크에 저장되어 있는 시퀀스를 한꺼번에 시퀀스 입력창에 넣을 수 있습니다. '시퀀스 넣기' 버튼을 클릭하면 아래 그림과 같이 Sequence A에 시퀀스가 입력됩니다.

　

Sequence B에 align할 시퀀스를 입력하고 'GO' 버튼을 클릭하면 결과 페이지가 출력됩니다.

결과 페이지 모습을 자세히 살펴봅시다.

Sequence B에 입력한 시퀀스가 align 기준 시퀀스가 됩니다.

　

각 아이콘의 기능은 다음과 같습니다.

	현재 보여주고 있는 결과를 프린터로 출력합니다.
	현재 보여주고 있는 결과를 텍스트 파일로 저장합니다.
	전체 결과를 새 창으로 보여줍니다.

　

Sequence A 에 입력했던 시퀀스 목록입니다. 목록을 클릭하면 각 시퀀스의 Needle 결과가 출력됩니다.

　

하나의 시퀀스를 기준으로 연속적으로 시퀀스를 align 분석할 경우 유용하게 이용할 수 있습니다. 다른 align 프로그램에서도 멀티 시퀀스 지원이 곧 되리라고 생각합니다. (Bl2SeqN, Water 등)